تهدف الاتفاقية بشكل رئيسي لتوطيد العلاقات بين الجامعتين، وتتضمن التعاون في مجال العلوم التطبيقية، مع تسليط الضوء على مجالات اللغة العربية والتركية، الهندسة، طب الأسنان، والصيدلة.
ومن أهم بنود الاتفاقية إقامة الأبحاث المشتركة في مجال الطب الشعبي والنباتات التي تنمو في تركيا والأردن، بالإضافة لتبادل الطلاب بين الجامعتين بهدف التدريب.